Le club de l'ASV Spratzern, fondé en 1920, crée une section féminine en 2006 appelé FSK St Pölten. L'équipe obtient sa promotion en première division en 2011. Le club connaît sa première participation en Coupe d'Europe lors de la Ligue des champions 2013-2014 ; elles sont éliminées dès les seizièmes de finale par les Italiennes du Torres Calcio Femminile.
Le club remporte son premier titre de champion d'Autriche en 2015, mettant ainsi fin à 12 années de règne du SV Neulengbach.
